它的主要危害有以下四点：

　　一是土地退化，耕地毁坏，威胁粮食安全。水土流失改变了部分土地利用现状，基本丧失第一性质的生产能力，使人们失去赖以生存耕地的基础，威胁到国家粮食安全；工程施工、弃渣和临时堆土运输及堆置、砂石料等建筑材料运输和堆置等还可能侵占农田，影响农作物的生长。 

　　二是江河湖库淤积，加剧洪涝灾害，威胁防洪安全。水土流失产生大量泥沙，有的直接倾入沟谷、河道，被水流携运；有的堆积坡面、坡脚，受水流冲蚀进入河流，形成高含沙量水流。当水流进入平缓河段、湖泊或受水库拦蓄影响时，泥沙逐渐堆积，河道过水断面减小，湖库有效库容减小，导致行洪能力减弱，河床抬升，直接威胁到两岸经济、社会发展和人民群众的生命财产安全和防洪安全。 

　　三是恶化生存环境，制约经济社会发展。开挖、填筑、弃渣和临时堆土等活动扰动原地貌，占压植被，形成大面积的裸露面，使沿线的生态环境遭到一定的损坏。同时，生产建设过程中扰动和损坏了原土层结构，易引起滑坡和泄流，同时开挖及排弃的大量土石沙，大大增加沟道输沙量，将损坏原农田灌溉渠系，影响铁路、公路运输及河流行洪安全，并给地区经济发展及生态环境建设造成一定影响，成为制约经济社会发展的重要因素。 

　　四是加重面源污染，威胁生态安全和饮水安全。面源污染是指溶解和固体的污染物从非特定地点，在降水或融雪的冲刷作用下，通过径流过程而汇入受纳水体（包括河流、湖泊、水库和海湾等）并引起有机污染、水体富营养化或有毒有害等其他形式的污染。水土流失为面源污染提供了物质载体，吸附在土壤颗粒上的污染物，随着地表径流进入水体，加剧了水体污染的发生和发展，直接威胁着生态环境和饮水安全。